.
Lenguaje: C
Localización: /opt/mira
Web: http://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet/
El programa se ha compilado con las opciones
MAXKMERLENGTH=127 CATEGORIES=3 OPENMP=1
Para activar el OpenMP, se debe indicar el número de procesos disponibles (depende de la cola o arquitectura del nodo qu eejecute el programa) con la variable OMP_NUM_THREADS
:
export OMP_NUM_THREADS=8
Se encuentra también instalado el script VelvetOptimiser, versión 2.2.0 en el directorio /opt/velvet/optimiser/2.2.0
. Su uso requiere la presencia tanto
el programa Velvet como del paquete BioPerl, por lo que ambos módulos deben estar cargados.